События разворачиваются в 1971 году, когда молодая американка Маргарет Дайно прибывает в Рим. Она готовится принять постриг и поселяется в католическом приюте, где когда-то воспитывался её наставник, кардинал Лоуренс. Город в это время бурлит от протестов и молодежных бунтов, но за стенами монастыря жизнь кажется тихой и размеренной. Маргарет делит комнату с раскрепощенной послушницей Лус и постепенно втягивается в работу с сиротами. Среди воспитанниц выделяется девочка по имени Карлита, которую монахини постоянно запирают в «комнате плохих мыслей». Маргарет видит в ребенке себя саму в детстве — такую же испуганную и одинокую, тем более что у девочки случаются странные припадки, а на стенах её камеры обнаруживаются жуткие рисунки угольем. Постепенно Маргарет замечает, что в монастыре происходит что-то странное: пугающие самоубийства, шепот в коридорах и настойчивое внимание со стороны отца Бреннана, который пытается предупредить её о заговоре внутри церкви.
Вместо подготовки к обряду посвящения героине приходится разбираться в темных делах высшего духовенства. Выясняется, что группа фанатиков боится потери влияния церкви из-за растущего безбожия в обществе и решает пойти на радикальные меры. Они верят, что только явление чистого зла в мир заставит людей в страхе вернуться к вере. Маргарет находит медицинские карты и фотографии, которые указывают на серию медицинских экспериментов над женщинами. Оказывается, что Карлита — лишь часть масштабного плана по рождению антихриста, а сама Маргарет попала в этот приют совсем не случайно. Ей приходится бежать, пытаясь спастись от системы, где врачи и священники работают сообща ради достижения пугающей цели. В подвалах клиники и темных залах монастыря она сталкивается с реальностью, где человеческая жизнь не стоит ничего по сравнению с церковной догмой, а её собственное прошлое оказывается плотно переплетено с рождением демонического младенца, который должен ознаменовать начало новой эры.