События разворачиваются в цифровом мегаполисе Аргон, который постепенно захватывают силы Клу. Главный герой, молодой механик по имени Бек, не собирается мириться с тем, как военные чиновники генерала Теслера устанавливают свои порядки в городе и стирают неугодные программы. После того как его близкого друга отправляют на переработку, Бек решается на отчаянный шаг: он надевает костюм Трона и устраивает диверсию, взрывая огромную статую диктатора. Парень думал, что действует в одиночку, но вскоре на него выходит настоящий Трон. Оказывается, легендарный защитник системы жив, хотя и сильно искалечен после старых сражений. Он решает сделать из вспыльчивого новичка своего преемника, чтобы тот стал новым лицом сопротивления и сплотил вокруг себя программы, которые уже потеряли всякую надежду на спасение.
Бек ведет двойную жизнь. Днем он копается в деталях в мастерской Аблера, общается с коллегами и пытается не вызывать подозрений, а ночью отправляется на опасные вылазки. Ему приходится постоянно тренироваться в убежище Трона, осваивать сложные маневры на светоциклах и учиться в совершенстве владеть световым диском, ведь малейшая ошибка в бою против элитных бойцов Клу приведет к окончательному удалению. Пока Теслер и его помощница Пейдж пытаются вычислить таинственного бунтовщика, Бек постепенно понимает, что восстание — это не просто красивые жесты, а тяжелая работа, где приходится делать сложный выбор и рисковать теми, кто ему дорог. Он разрушает инфраструктуру оккупантов, перехватывает важные данные и шаг за шагом расшатывает контроль Клу над сектором, превращаясь из обычного ремонтника в символ, способный перевернуть привычный цифровой уклад.
