Джесси уже заметно подрос и теперь работает на исследовательском судне, которое занимается мониторингом популяции косаток. Команда пытается выяснить, почему численность животных в этих водах начала резко падать. В это же время неподалёку курсирует небольшое судно, на котором отец-китобой пытается приучить своего десятилетнего сына Макса к семейному ремеслу. Мужчина промышляет незаконной добычей мяса, считая это обычным делом, но мальчик явно не в восторге от происходящего. Вилли, который успел обзавестись подругой по имени Ники и ждёт пополнения, постоянно крутится рядом с этими лодками. Ситуация обостряется, когда системы слежения фиксируют подозрительную активность, и становится понятно, что на косаток ведётся настоящая охота с использованием гарпунов и акустических обманок.
Конфликт закручивается вокруг того, как Макс случайно знакомится с Джесси и начинает понимать, что киты — это не просто куски мяса, а разумные существа, умеющие общаться и чувствовать. Отец Макса настроен решительно и даже агрессивно, он выходит в море за очередной добычей, не подозревая, что Вилли и его стая будут защищаться. В один момент лодка браконьеров оказывается под угрозой из-за маневров рассерженного кита, и китобой сам едва не оказывается в воде. Джесси и Максу приходится действовать сообща, чтобы предотвратить столкновение и убедить взрослых прекратить бессмысленную резню. В конечном итоге всё сводится к тому, успеет ли команда исследователей заблокировать выход китобоев на позицию до того, как будет сделан решающий выстрел, и сможет ли маленький мальчик пойти против воли своего сурового отца ради спасения морских обитателей.
