Лисбет Саландер оказывается на больничной койке в критическом состоянии. После жестокой стычки с отцом у неё пуля в голове, и врачи буквально собирают её по частям. Палата превращается в камеру, за дверью дежурит полиция, а сама девушка формально считается арестованной. Её обвиняют в нескольких убийствах и попытке покушения, так что сразу после выписки Лисбет ждёт не свобода, а судебный процесс. Ситуация осложняется тем, что в той же больнице, всего через пару дверей, лежит её раненый отец, который мечтает закончить начатое. Лисбет практически не может двигаться, но всё равно пытается выйти на связь с внешним миром, используя пронесенный тайком карманный компьютер. Она понимает, что против неё работает целая секретная группа внутри спецслужб, готовая убрать свидетелей, лишь бы скрыть старые преступления и факты незаконного содержания Лисбет в психиатрической клинике в детстве.
Журналист Микаэль Блумквист в это время пытается раскопать архивы и найти доказательства существования этой теневой организации. Он понимает, что оправдать Лисбет в суде можно только одним способом: вытащить на свет всю правду о её прошлом и о том, кто именно замял дело Залаченко много лет назад. Пока юристы готовятся к процессу, Микаэль собирает специальный выпуск своего журнала, рискуя собственной жизнью, так как за ним начинают следить те же люди, что охотятся на Лисбет. В зале суда разворачивается настоящая битва, где прокурор пытается выставить Саландер невменяемой и опасной для общества социопаткой. Лисбет приходится сохранять ледяное спокойствие, пока её адвокат шаг за шагом разрушает обвинение, используя данные о коррупции в верхах. Становится ясно, что это не просто уголовное дело, а попытка системы раздавить человека, который слишком много знает о грязных методах работы государственных структур.